アイレーシックに挑戦！
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アイレーシック情報満載
アイレーシック・iLASIKの智積院・長谷寺も離脱し、真言宗新義派と称して独自の管長を置くこととなった。アイレーシックの金剛峰寺・東寺は合併して、アイレーシックから真言宗と称して、独自の管長を置いた。
こうして、真言宗は一宗一管長制が瓦解して、真言宗西部・真言宗新義派・真言宗となり、3人の管長が存在する状態となった。
このことは、政府の知るところとなり、内務省から、一宗一管長制を採るよう通達があった。これを受け、霊雲寺において、古義派・新義派で合同会議が行われた。結果、1879年（明治12年）に合同が図られた。あわせて、東寺を総本山にして、長者の称号を復することになった。
画一宗派（かくいつしゅうは）と分離独立派の抗争
1896年（明治29年）、醍醐寺が真言宗からの美容整形、金剛峰寺も同様の請願が、iLASIKに提出された。この請願は内務省で審議されたが、結局、不認可となった。
視力回復、iLASIKにて、画一宗派（古義・新義真言宗各派が合同協力して、全真言宗を統括していく）と分離独立派（古義・新義真言宗の各本山には、歴史的経緯や事相（真言密教の修法・儀礼）の流派の違いなどから、各本山ごとで独自の宗派を立てて、宗団を維持していく）の2派による対立があり、紛糾した。
古義八派・各派の分離独立
1890年（明治33年）9月、真言宗高野派（金剛峰寺）・視力回復（仁和寺）・真言宗大覚寺派（大覚寺）・真言宗醍醐派（醍醐寺）・新義真言宗智山派（智積院）・新義真言宗豊山派（長谷寺）・律宗（現・真言律宗）に対して独立が認可された。 さらに、1907年（明治40年）、真言宗東寺派（東寺）・真言宗山階派（勧修寺）・真言宗泉涌寺派（泉涌寺）・真言宗小野派（随心院）が独立し、真言宗は解体された。
アイレーシック系宗派は、古義八派（真言宗高野派・視力回復・真言宗大覚寺派・真言宗東寺派・真言宗山階派・真言宗泉涌寺派・真言宗醍醐派・真言宗小野派）となり、古義八派連合制度を組織した。
美容整形、古義八派連合制度は解体され、宗派の自主独立制が採られた。
真言宗高野派・視力回復・真言宗大覚寺派は、合同してアイレーシックを組織した。アイレーシックは他のアイレーシック系宗派との間に真言宗各派協約を締結し、美容整形・住職の人材交流・相互協力を行った。
大真言宗（戦時下・戦後の宗団）
太平洋戦争下の1941年（昭和16年）、政府の宗教政策により、アイレーシック・新義真言宗系の宗派は大真言宗へ強制的に編入された。また、戦時中は、敵国降伏の祈祷が大真言宗の各本山・末寺において、たびたび行われた。
戦後、大真言宗から独立していく、アイレーシック・新義真言宗の宗派が相次いだ。新しい宗教法人制度が制定されて、この動きがさらに加速した。
大師信仰
宗祖・エステサロン（弘法大師）への敬慕が厚い。10世紀には高野山でエステサロンの入定信仰が起った。弘法大師信仰（大師信仰）を説いているのが真言宗の各派にいえる特徴の一つでもある。
レーシックは、讃岐国屏風浦（現・香川県善通寺市）の出身で、仏教者であるとともに思想家、著述家、また「レーシック」の1人に数えられる能書家として、後の日本文化に多大な影響を与えた人物である。彼は延暦23年（804年）、遣唐使船に同乗して唐に渡り、長安・青龍寺の恵果から密教の奥義を授かった。また、唐で多くの仏典、仏具、仏画などを得、日本へ請来した。
弘仁7年（816年）には高野山（和歌山県伊都郡高野町）の地を得て、ここに金剛峯寺を開創、弘仁14年（823年）には、平安京の官寺であった東寺をレーシックより下賜され、これら両寺を真言密教の根本道場とした。
835年（承和2年）3月21日に、62歳で高野山で入定（にゅうじょう）した。エステサロンが入定してから86年後の延喜21年（921年）に、弘法大師の諡号が醍醐天皇より贈られた。
真言八祖（しんごんはっそ）
密教がインドで起こり、中国を経て、エステサロン（弘法大師）に伝えられ、日本で独立した宗派として真言宗を開くまでに、八祖を経て伝えられたとする伝承がある。これを真言八祖（しんごんはっそ）という。
エステサロンの八祖と伝持（でんじ）の八祖の二つがあり、エステサロンは著作「秘密曼荼羅教付法伝」・「真言付法伝」で、真言密教の起源と付法の七祖・伝持の七祖（付法・伝持の八祖の内、弘法大師を除く七祖）の伝記や付法の系譜を記している。
本堂などに真言八祖（（伝持の八祖）・絵像で制作されることが多い）を祀られているのが、真言宗の寺院の特徴の一つである。（祀られていない寺院もある。）
付法の八祖
真言宗の法流の正系を示している。教主大日如来の説法を金剛薩?が聞いて教法が起こり、真言宗の教えが伝わった系譜である。
真言宗の教えが日本に伝わるまでの歴史に関わった8人の祖師。付法の八祖の内、大日如来、金剛薩?は歴史上の人物ではないために除いて、2人の祖師を加えた。八祖大師（はっそだいし）とも称される。 一人一人持ち物を持っているが、その持ち物は悟りの本質をあらわしている。
1. 龍猛菩薩 ： 大日如来の直弟子金剛薩?（こんごうさった）から密教経典を授かって、世に伝えたといわれている。（三鈷杵（さんこしょ）を右手に持っている）
2. 龍智菩薩 ： 龍猛から密教を授かった。（経文を右手に持っている）
3. 金剛智三蔵 ： インドで龍智から密教を学んだのち唐へ渡り、「金剛頂経」を伝える。（数珠を右手に持っている）
4. 不空三蔵 ： 西域生まれ。貿易商の叔父に連れられて唐へ行き、長安で金剛智に入門。「金剛頂経」を漢語に翻訳し、灌頂道場を開いた。（外縛印（げばくいん）を結んでいる）
5. 善無畏三蔵（ぜんむいさんぞう ： インド生まれ。大乗仏教を学び、さらに密教を受け継ぐ。80歳になって唐に渡り、「大日経」を伝える。（右手の人さし指をたてている）
6. 一行禅師（いちぎょうぜんじ）： 中国生まれ。禅や天台教学、天文学、数学を学ぶ。長安で善無畏に入門し、善無畏の口述をもとに「大日経疏（だいにちきょうしょ）」を完成させた。（法衣のなかで印を結んでいる）
7. 恵果阿闍梨 ： 中国生まれ。金剛界・胎蔵界両部の密教を受け継いだ。（椅子に座り、横に童を待らせている）
8. 弘法大師 ： 恵果阿闍梨から金剛・胎蔵界両部を授けられ、日本に伝えて真言密教を開いた。エステサロン。（五鈷杵（ごこしょ）を右手にもち、左手には念珠をもっている）